La Dirección Académica dirige y supervisa el Proceso Estratégico y Académico y los Procesos clave de Docencia y de Investigación y Extensión que se llevan a cabo, al igual que supervisa la elaboración, evaluación, actualización y acreditación de los Planes y Programas de Estudio.
La Subdirección de Planeación y Evaluación coordina la elaboración e integración del Programa de Desarrollo Institucional, además del seguimiento y evaluación de sus objetivos de acuerdo con las metas de corto, mediano y largo plazo, también coordina las sesiones del Equipo de Mejora Regulatoria y la formalización de sus actas.
Elabora el Programa Anual conforme a la estructura programática de la institución, así como el seguimiento y evaluación de los indicadores que integran la Matriz de Resultados. Asimismo, mantiene actualizada la estadística institucional y establece los mecanismos adecuados para su difusión, al igual que, realiza e integra los informes de evaluación de conformidad con la normatividad vigente.
La Subdirección de Programación y Presupuestación es la encargada de Coordinar y dar seguimiento al proceso clave de programación y presupuestación, Elaborar el anteproyecto de presupuesto, con base a las necesidades del Centro, cumpliendo con la normatividad vigente, Llevar el seguimiento y aplicación programática-presupuestal, de las modificaciones y reprogramaciones del presupuesto autorizado., Integrar el anteproyecto de inversión y el programa anual de adquisiciones, con base a las necesidades presentadas y justificadas por las áreas que conforman el Centro, cumpliendo con la normatividad vigente, Elaborar la cartera de inversión de acuerdo con la normatividad vigente para tales efectos y registrarla en la SHCP y Elaborar los oficios de inversión de equipamiento y obra pública y llevar a cabo su registro ante la SHCP en los tiempos establecidos.